福建、广东、江西、湖南、安徽等地有不少的外塘越冬甲鱼，这些外塘甲鱼，大部分池塘在头年9月底开始盖保温大棚，第二年5月中下旬拆除，部分池塘在越冬期间有锅炉加温。但总结现状，这些保温效果都不甚理想，水温远远低于甲鱼生长要求的最佳温度；部分水温甚至在10℃以内，甲鱼进入冬眠状态。综上，本文将这些统统规整于越冬甲鱼。
在第二年5月中下旬后，气温上升，水温随之提高，甲鱼从冬眠状态开始大量摄食、进入快速生长状态，但诸多病害也随之而来。因此，针对不同病因采取相应处理措施显得尤为重要。
水温在10℃～12℃时，甲鱼即会钻入泥沙中潜藏越冬，越冬期间甲鱼的新陈代谢显著降低，但仍会有呼吸。如若是久未清理的老池塘，池底泥沙中蓄积着大量的亚硝酸盐、硫化氢、氨氮和甲烷，甲鱼就会在越冬期间或者越冬后表现出不同程度的中毒症状、甚至死亡。建议每年彻底清理一次池底淤泥，多用池底改良制剂，如降硝解毒宝，特别是在甲鱼越冬前可大剂量使用，一般每方水用量10克。
甲鱼在越冬期间的抵抗力最弱，其生病的临界阈值较冬眠前降低很多，致病体的侵袭就来的容易得多，这也是为什么甲鱼在冬眠后极易患病的原因。
部分甲鱼在越冬前有疾病或处于亚健康状态，越冬前达不到越冬所需要的肥满度，经过一个没有摄食的漫长冬季，加上内伤的消耗，体质极度衰弱，导致越冬期间死亡，特别是冬眠结束后甲鱼开始运动时，由于耗能陡然增加，甲鱼内脏功能迅速衰竭，导致大量死亡。建议在越冬前对甲鱼进行严格选别，挑选出发病、瘦弱的甲鱼，只有活力好、肥满度高的健康甲鱼才能放养越冬。此外，最好在越冬前2个月，对甲鱼投喂高品质饲料，并在饲料中添加3%左右的冬化鱼油，以达到甲鱼快速催肥的目的，使甲鱼体内蓄积有足够的能量用以越冬期间的消耗。
这种情况多发生在11～6月份，特别是甲鱼越冬结束，拆除保温棚后。病原体嗜水气单胞菌侵袭甲鱼的肝脏、肾脏、脾脏和血液，发病甲鱼的头顶、底板、四肢充血，严重者口鼻出血、腹腔充血。该病多呈暴发状，一旦发作较难控制。预防时建议每年清理一次池塘，至少2年彻底清理一次，池底泼洒生石灰并搅拌混合；养殖期间做好日常消毒；并在饲料中经常添加好肝胆，用量为2～3克/公斤饲料，以用以保护甲鱼的免疫器官。发病时，如若感染严重，须将池水全部排干，加入新水，并用消毒剂消毒；内服：每公斤饲料中添加3克头孢拉定、水产复合B粉10克，连用10天。
总之，越冬对甲鱼来说是一个严峻的生死考验，越冬前的饲喂管理尤为重要；越冬后要仔细观察，发现状况及早处理，依然能达到亡羊补牢的目的。