1、自制的酸奶不是很安全，自制酸奶会有有害菌污染，酸奶是牛奶经过乳酸菌发酵而成的，属于发酵乳。国标中允许发酵乳使用添加剂，这是生产工艺的需要。添加剂合理限量使用，并不会对人体健康产生危害。所以，不用太担心酸奶含添加剂的问题。自制酸奶可以不用添加剂。不过，这并不意味着自制酸奶会更安全。因为，自制酸奶需要发酵，发酵需要微生物参与。由于环境中也存在大量细菌，所以发酵前必须对原料牛奶和发酵器具等进行杀菌。然而，普通家庭环境中自制酸奶，基本无法保证严格的杀菌条件。
2、自制酸奶口感不好，有做过酸奶的朋友应该都知道,我们自己制作的酸奶在口感上要比外面买到的酸奶差一些。这是因为自制酸奶需要在42C~45°C的环境中进行发酵，这是保加利亚乳杆菌和嗜热链球菌混合后的最适宜生长温度。但是，普通家庭自制酸奶很难保证这样的条件，极易受天气影响，受热不均匀，容易发酵过度或发酵不足，最终导致自制酸奶的口感并不好的主要原因。
3、酸奶和很多食物搭配起来都很不错，特别是早餐配着面包、点心，有干有稀，口感好还营养丰富。但千万不要和香肠、腊肉等高油脂的加工肉品一起食用。因为加工肉品内添加了硝，也就是亚硝酸，会和酸奶中的胺形成亚硝胺，是致癌物。
4、酸奶机材质不安全，某媒体抽样市场酸奶机的60%都是不锈钢，而且都是低价产品，不知名产品。而风险监测发现，用不锈钢容器盛放酸性物质，存在化学反应渗出有害金属问题。而长时间使用不锈钢酸奶机，不锈钢内胆被酸性分解，渗出镍（nie）和铬（ge）。而当镍和铬摄入超过一定标准的话，对器官和大脑发育会有一定损害，比如说记忆力衰退等肝功能问题。